ELECO 2026 Davetli Konuşmacılar


Derin Öğrenme Yöntemleri ile Beyin Tümörlerinde Genetik Mutasyon Tahmini

Esin ÖZTÜRK IŞIK

Boğaziçi Üniversitesi
Biyomedikal Mühendisliği Enstitüsü
Kandilli Kampüsü 34684 Çengelköy / İstanbul
esin.ozturk@bogazici.edu.tr


Özet – Beyin tümörlerinde genetik alt tiplerin ve mutasyonların doğru şekilde belirlenmesi, 2021 Dünya Sağlık Örgütü (WHO) santral sinir sistemi tümör sınıflandırması kapsamında büyük önem kazanmıştır (Louis et al., 2021).

Gliomlarda izositrat dehidrogenaz (IDH) ve telomeraz ters transkriptaz (TERT) mutasyonları, meningiomlarda ise nörofibromatozis 2 (NF2) mutasyonu ve S100 protein ekspresyonu tespiti beyin tümörü biyolojisini anlamada ve hasta yönetiminde öne çıkmaktadır.

İleri manyetik rezonans görüntüleme (MRG) teknikleriyle elde edilen çoklu parametreli veriler, genetik mutasyonların non-invaziv olarak öngörülmesinde önemli rol oynamaktadır. Son yıllarda derin öğrenme tabanlı modeller, bu çok boyutlu MRG verileriyle genetik mutasyonların otomatik, hızlı ve yüksek doğrulukla tahmin edilmesini mümkün kılmıştır.

Bu konuşmada, derin öğrenme destekli ileri MRG analizlerinin, beyin tümörlerinde genetik mutasyonların non-invaziv olarak saptanmasındaki rolü ve klinik uygulamalara etkisi tartışılacaktır.

Proje Desteği: TUBITAK 216S432 ve 119S520, TACTIX Horizon Europe programme #101159624
 


Prof. Dr. Esin ÖZTÜRK IŞIK

Özgeçmiş - Prof. Dr. Esin ÖZTÜRK IŞIK, Boğaziçi Üniversitesi Biyomedikal Mühendisliği Enstitüsü’nde öğretim üyesidir.

Dr. Esin Öztürk Işık, lisans eğitimini Orta Doğu Teknik Üniversitesi (ODTÜ) Bilgisayar Mühendisliği Bölümü’nde tamamladı. Daha sonra University of Alabama at Birmingham’da Biyomedikal Mühendisliği yüksek lisans derecesini aldı. Ardından, University of California, Berkeley ve University of California, San Francisco’nun ortak Biyomühendislik programında doktora çalışmalarını tamamladı. Sonrasında, University of California, San Francisco Radiology ve Biomedical Imaging bölümünde doktora sonrası araştırmalar gerçekleştirdi.

Dr. Öztürk Işık'ın araştırmalarının temel hedefi, beyin hastalıklarının biyolojisinin anlaşılmasını ilerletmek için yeni moleküler manyetik rezonans (MR) görüntüleme teknikleri geliştirmektir.

Boğaziçi Üniversitesi Biyomedikal Mühendisliği Enstitüsü Hesaplamalı Görüntüleme Laboratuvarı'ndaki teknik projeler, moleküler MR görüntüleme verilerinin elde edilmesi, işlenmesi ve nicel değerlendirilmesi için yeni algoritmalar tasarlamaya odaklanmaktadır.



Ayrıca araştırma grubu, MR görüntü analizi için makine öğrenmesine dayalı hesaplamalı yöntemler geliştirmektedir.

Avrupa Birliği, TÜBİTAK ve Amerika Birleşik Devletleri Department of Defense’den araştırma fonları almıştır. Bunlar arasında “Twinning Approach for Computational MRI Technology and Innovation Excellence in Türkiye (TACTIX)” başlıklı HORIZON-WIDERA-2023-ACCESS-02-01 Twinning Bottom-Up desteği de bulunmaktadır.

Laboratuvarı için sağlanan bu ana fonlar, beyin hastalıkları olan kişilerin yaşam kalitesini artırmaya yönelik klinik karar destek araçlarının geliştirilmesini desteklemiştir.

Dr. Öztürk Işık, aynı zamanda Beyin ve Teknoloji alanında bir Avrupa Üniversitesi ittifakı olan NeurotechEU’nun da aktif bir üyesidir. International Society for Magnetic Resonance in Medicine (ISMRM) ve European Society of Magnetic Resonance in Medicine and Biology (ESMRMB) üyesidir ve çeşitli teknik ve konferans organizasyon komitelerinde görev almıştır.